Umetnički fond Muzeja počeo je da se formira u vreme osnivanja Moderne galerije, da bi u trenutku otvaranja Muzeja brojao oko 3500 umetničkih dela. Danas fond broji oko 8000 dela i predstavlja najreprezentativniju kolekciju jugoslovenskog umetničkog prostora iz perioda njegovog postojanja (1900 – 1991).
Danas Muzej savremene umetnosti svoju politiku popunjavanja zbirki podjednako zasniva na praćenju savremene umetnosti u Srbiji, regiona Balkana, i, u onoj meri koliko je to moguće, Evrope i sveta. Muzej svoje zbirke dopunjuje otkupom od umetnika (sa tekućih izložbi i iz ateljea umetnika), putem poklona ili legata.