Уметнички фонд Музеја почео је да се формира у време оснивања Модерне галерије, да би у тренутку отварања Музеја бројао око 3500 уметничких дела. Данас фонд броји око 8000 дела и представља најрепрезентативнију колекцију југословенског уметничког простора из периода његовог постојања (1900 – 1991).
Данас Музеј савремене уметности своју политику попуњавања збирки подједнако заснива на праћењу савремене уметности у Србији, региона Балкана, и, у оној мери колико је то могуће, Европе и света. Музеј своје збирке допуњује откупом од уметника (са текућих изложби и из атељеа уметника), путем поклона или легата.
